В одном местечке около селения Листа состоялась битва, после которой одним из джоунинов-медиков был найден мальчик. Мужчина взял паренька себе и вырастил как сына, преподавая ему основы медицины и медицинские дзюцу. Работая шпионом Орочимару, Кабуто участвовал в экзаменах на чуунина семь раз, безопастно собирая сведения о шиноби из разных стран. Во время экзамена он использует гендзюцу, чтобы усыпить множество людей на стадионе, но вторжение оказалось неудачным. После Кабуто и Орочимару искали Цунаде, чтобы та исцелила змеиного саннина, но в результате им пришлось вступить в бой, а затем снова бежать.
Спустя несколько лет, селение Листа получило данные, что Кабуто был шпионом Сасори. Используя внешность Сасори шиноби Листа хотели захватить Кабуто, но встретили сопротивление, поскольку Орочимару и Кабуто хотели расправиться с марионеточником сами. Выяснилось, что Орочимару сумел снять блокировку памяти  с Кабуто и тот стал его преданным соратником. После трансформации Наруто в четырехвостого и сражения с ним Орочимару, Кабуто вместе с сенсеем бежал в логово, где получил данные от Сая и значительно расширил свои знания о способностях шиноби Листа. После предательства Сая и своего пленения, Кабуто вернулся в убежище, где Саске расправился с Орочимару.
Имея ткани сенсея, он вживил некоторую их часть в себя, в результате чего те начали распространяться по его телу. Отследив команду Наруто, он выдал им информацию об Акацуках, надеясь что те расправятся с еще некоторыми ее членами.
Вновь мы видим Кабуто уже полностью преобразовавшегося и освоившегося со своими способностями. Он предлагает союз Учихе Мадаре, демонстрируя улучшенный Эдо Тенсей своего учителя и призывая пятерку мертвых Акацук и неизвестное шестое тело. После с помощью своих способностей он воскрешает большое количество шиноби, ткани которых он смог найти. Несмотря на это, он все еще имеет несколько тузов в рукаве.

Хладнокровный ( достаточно долгое время работал с трупами, оперировал их) и двуличный лицемер, способный на любую подлость ради достижения своих целей. Достаточно циничен и неприятен в общении, но не старается хоть как-то изменить это. Не страдает излишней прямолинейностью, а наоборот, склонен умалчивать небольшие, но важные сведения. Имеет неплохой потенциал в плане многоходовых операций, поскольку способен просчитать ситуацию на несоклько шагов вперед. Благодаря обширным знаниям о способностях различных шиноби может своевременно и эффективно отреагировать на практически любое действие со стороны противника. Не доверяет никому, считая это слишком неосмотрительным поведением. Имеет склонность к длительным дискуссиям, в ходе которых способен без труда выловить необходимую ему информацию.